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Qu'est-ce qu'un peptide? Définition et exemples

Qu'est-ce qu'un peptide? Définition et exemples


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Un peptide est une molécule constituée de deux acides aminés ou plus liés entre eux par des liaisons peptidiques. La structure générale d'un acide aminé est la suivante: R-CH (NH2) COOH. Chaque acide aminé est un monomère qui forme une chaîne peptidique polymère avec d’autres acides aminés lorsque le groupe carboxyle (-COOH) d’un acide aminé réagit avec le groupe amino (-NH).2) d'un autre acide aminé, formant une liaison covalente entre les résidus d'acide aminé et libérant une molécule d'eau.

Points à retenir: peptides

  • Un peptide est un polymère formé en liant des sous-unités d’acides aminés.
  • Une molécule peptidique peut être biologiquement active seule ou peut servir de sous-unité pour une molécule plus grande.
  • Les protéines sont essentiellement de très gros peptides, souvent constitués de plusieurs sous-unités peptidiques.
  • Les peptides jouent un rôle important en biologie, en chimie et en médecine, car ils constituent des éléments constitutifs des hormones, des toxines, des protéines, des enzymes, des cellules et des tissus corporels.

Les fonctions

Les peptides sont des molécules biologiquement et médicalement importantes. Ils se produisent naturellement dans les organismes. En outre, les composés synthétisés en laboratoire sont actifs lorsqu'ils sont introduits dans l'organisme. Les peptides agissent en tant que composants structurels des cellules et des tissus, hormones, toxines, antibiotiques et enzymes. Les exemples de peptides comprennent l’hormone oxytocine, le glutathion (stimulant la croissance des tissus), la mélittine (venin d’abeille), l’insuline, une hormone pancréatique, et le glucagon (un facteur hyperglycémique).

La synthèse

Les ribosomes dans les cellules construisent de nombreux peptides, car l'ARN est traduit en une séquence d'acides aminés et les résidus sont liés ensemble. Il existe également des peptides non-ribosomaux, qui sont construits par des enzymes plutôt que par des ribosomes. Dans les deux cas, une fois que les acides aminés ont été liés, ils subissent des modifications post-traductionnelles. Ceux-ci peuvent inclure l'hydroxylation, la sulfonation, la glycosylation et la phosphorylation. Alors que la plupart des peptides sont des molécules linéaires, certains forment des anneaux ou des structures de lariat. Moins souvent, les acides aminés L subissent une racémisation pour former des acides aminés D au sein de peptides.

Peptide par rapport à la protéine

Les termes "peptide" et "protéine" sont couramment confondus. Tous les peptides ne forment pas de protéines, mais toutes les protéines sont constituées de peptides. Les protéines sont de gros peptides (polypeptides) contenant au moins 50 acides aminés ou molécules constituées de multiples sous-unités peptidiques. En outre, les protéines présentent généralement une structure plus complexe que des peptides plus simples.

Classes de peptides

Les peptides peuvent être classés soit par leur fonction, soit par leur source. Le manuel de peptides biologiquement actifs énumère des groupes de peptides, notamment:

  • Peptides antibiotiques
  • Peptides bactériens
  • Peptides du cerveau
  • Cancer et peptides anticancéreux
  • Peptides cardiovasculaires
  • Peptides endocrines
  • Peptides fongiques
  • Peptides gastro-intestinaux
  • Peptides invertébrés
  • Peptides opiacés
  • Peptides végétaux
  • Peptides rénaux
  • Peptides respiratoires
  • Peptides de vaccins
  • Peptides de venin

Nommer les peptides

Ceci est un exemple de tétrapeptide, avec l'extrémité N-terminale en vert et l'extrémité C-terminale en bleu. Jü

Les peptides sont nommés en fonction du nombre de résidus d’acides aminés qu’ils contiennent ou en fonction de leur fonction:

  • Monopeptide: consiste en un acide aminé
  • Dipeptide: consiste en deux acides aminés
  • Tripeptide: a trois acides aminés
  • Tétrapeptide: a quatre acides aminés
  • Pentapeptide: a cinq acides aminés
  • Hexapeptide: a six acides aminés
  • Heptapeptide: a sept acides aminés
  • Octapeptide: a huit acides aminés
  • Nonapeptide: a neuf acides aminés
  • Décapeptide: a dix acides aminés
  • Oligopeptide: composé de deux à vingt acides aminés
  • Polypeptide: chaîne linéaire de nombreux acides aminés liés par des liaisons amides ou peptidiques
  • Protéine: constituée de plus de 50 acides aminés ou de plusieurs polypeptides
  • Lipopeptide: consiste en un peptide lié à un lipide
  • Neuropeptide: tout peptide actif dans le tissu neural
  • Agent peptidergique: produit chimique qui module le fonctionnement des peptides
  • Protéose: peptides produits par l'hydrolyse de protéines

Peptides dans le sport

Deux types de peptides sont classés comme substances interdites au Tableau 2 (S2) sur la Liste des interdictions de l'Agence mondiale antidopage (AMA), sur la Liste des interdictions de l'Agence des États-Unis d'Amérique (USADA) et par l'Autorité antidopage des sports australiens. Les hormones peptidiques et les peptides de sécrétagogue sont interdits aux athlètes professionnels, qu'ils soient ou non en compétition, car les produits chimiques agissent en tant qu'améliorants de la performance. Les peptides interdits sont les hormones de croissance, celles qui augmentent l'oxygénation du sang, celles qui affectent la croissance et la réparation des muscles et celles qui provoquent la sécrétion d'hormones par des organes du système endocrinien (ovaires, testicules, thyroïde, par exemple). Les substances sont interdites non seulement parce qu'elles peuvent procurer aux athlètes un avantage injuste par rapport à leurs pairs, mais également parce que leur utilisation peut augmenter le risque d'hypertension, d'intoxication par l'eau, de lésions cardiaques et hépatiques et de cancer.

Sources

  • Abba J. Kastin, ed. (2013). Manuel de peptides biologiquement actifs (2e éd.). ISBN 978-0-12-385095-9.
  • Ardejani, Maziar S .; Orner, Brendan P. (2013-05-03). "Obéir aux règles de l'Assemblée peptidique". Science. 340 (6132): 561-562. doi: 10.1126 / science.1237708
  • Finking R, Marahiel MA; Marahiel (2004). "Biosynthèse de Peptides Nonribosomaux". Revue annuelle de microbiologie. 58 (1): 453-88. doi: 10.1146 / annurev.micro.58.030603.123615
  • IUPAC. Compendium de terminologie chimique2e éd. (le "Livre d'or"). Compilé par A. D. McNaught et A. Wilkinson. Blackwell Scientific Publications, Oxford (1997). ISBN 0-9678550-9-8.


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